Situé dans la ville de Bray-Dunes, au bord de la mer du Nord, à la frontière avec la Belgique, le collège se trouve donc entre la ville de Dunkerque, à 15 kilomètres à l’ouest, et, la petite ville belge de La Panne à l’est, à 10 km par la route mais à environ 2 km par la plage.
Bray-Dunes est la commune la plus septentrionale de France. Le nom du collège du Septentrion fait référence à cette particularité.
